Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ripk3Q9QZL0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ripk3Q9QZL0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms