Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Copg1Q9QZE5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Copg1Q9QZE5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms