Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trpc3Q9QZC1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trpc3Q9QZC1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms