Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Six6Q9QZ28 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Six6Q9QZ28 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Six6Q9QZ28 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Six6Q9QZ28 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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