Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Exo1Q9QZ11 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Exo1Q9QZ11 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Exo1Q9QZ11 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms