Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Phtf1Q9QZ09 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms