Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxe3Q9QY14 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms