Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cbx8Q9QXV1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cbx8Q9QXV1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms