Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pcsk1nQ9QXV0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pcsk1nQ9QXV0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms