Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXJ1

Apbb1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apbb1Q9QXJ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Apbb1Q9QXJ1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Apbb1Q9QXJ1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms