Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim44Q9QXA7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim44Q9QXA7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms