Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cyth1Q9QX11 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cyth1Q9QX11 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms