Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rai2Q9QVY8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rai2Q9QVY8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms