Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Dkk3Q9QUN9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms