Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cln8Q9QUK3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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