Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Chst11Q9JME2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Chst11Q9JME2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms