Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM99

Prg4, Proteoglycan 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg4Q9JM99 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Prg4Q9JM99 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Prg4Q9JM99 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Prg4Q9JM99 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Prg4Q9JM99 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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