Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM58

Crlf1, Cytokine receptor-like factor 1, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf1Q9JM58 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf1Q9JM58 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf1Q9JM58 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf1Q9JM58 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crlf1Q9JM58 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crlf1Q9JM58 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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