Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rabgef1Q9JM13 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rabgef1Q9JM13 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rabgef1Q9JM13 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rabgef1Q9JM13 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Rabgef1Q9JM13 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rabgef1Q9JM13 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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