Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM05

Pias4, E3 SUMO-protein ligase PIAS4, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pias4Q9JM05 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pias4Q9JM05 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pias4Q9JM05 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms