Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Higd1aQ9JLR9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms