Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tlr5Q9JLF7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms