Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nectin3Q9JLB9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nectin3Q9JLB9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nectin3Q9JLB9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nectin3Q9JLB9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms