Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CtsmQ9JL96 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CtsmQ9JL96 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms