Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL21

Ccr10, C-C chemokine receptor type 10, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr10Q9JL21 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr10Q9JL21 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr10Q9JL21 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr10Q9JL21 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr10Q9JL21 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccr10Q9JL21 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccr10Q9JL21 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms