Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrac1Q9JKP8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chrac1Q9JKP8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms