Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pole3Q9JKP7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms