Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nectin1Q9JKF6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms