Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scamp5Q9JKD3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Scamp5Q9JKD3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms