Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ybx3Q9JKB3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms