Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Uchl3Q9JKB1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Uchl3Q9JKB1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms