Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms