Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Efcc1Q9JJF6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efcc1Q9JJF6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms