Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Riox1Q9JJF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Riox1Q9JJF3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Riox1Q9JJF3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Riox1Q9JJF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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