Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smad9Q9JIW5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms