Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI70

Mkks, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MkksQ9JI70 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MkksQ9JI70 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
MkksQ9JI70 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms