Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RabggtaQ9JHK4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
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