Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Tmod3Q9JHJ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmod3Q9JHJ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmod3Q9JHJ0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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