Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
OtofQ9ESF1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
OtofQ9ESF1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms