Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chrnb2Q9ERK7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms