Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snap29Q9ERB0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snap29Q9ERB0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms