Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfcp2Q9ERA0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfcp2Q9ERA0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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