Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Ndst3Q9EQH7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndst3Q9EQH7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms