Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SgshQ9EQ08 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SgshQ9EQ08 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms