Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clstn1Q9EPL2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Clstn1Q9EPL2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms