Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gpr88Q9EPB7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gpr88Q9EPB7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms