Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnft1Q9DCN7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms