Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Xab2Q9DCD2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Xab2Q9DCD2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms