Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hmgn3Q9DCB1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hmgn3Q9DCB1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms