Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Swt1Q9DBQ9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Swt1Q9DBQ9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Swt1Q9DBQ9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Swt1Q9DBQ9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Swt1Q9DBQ9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms